Америка галиме Эрик С. Ландер рәсми рәвештә бер нуклеотид полиморфизмын (SNP) өченче буын молекуляр маркеры итеп тәкъдим иткәннән соң, SNP икътисади үзенчәлекләр ассоциациясе анализында, биологик генетик бәйләнеш картасы төзелешендә һәм кеше патогеник ген скринкасында киң кулланылды., Авыру куркынычын диагностикалау һәм фаразлау, наркотикларны индивидуаль тикшерү, һәм башка биологик һәм медицина тикшеренүләре.Акча культураларын үрчетү өлкәсендә, SNP-ны ачыклау кирәкле сыйфатларны иртә сайлап алырга мөмкин.Бу сайлау югары төгәллек характеристикасына ия һәм морфология һәм экологик факторларның комачаулавыннан эффектив рәвештә саклана ала, шуның белән үрчетү процессын кыскарта.Шуңа күрә, SNP төп тикшеренүләр өлкәсендә зур роль уйный.

Бер Нуклеотид Полиморфизмы (Бер Нуклеотид Полиморфизмы, SNP) бер үк яки төрле төр кешеләрнең ДНК эзлеклелегендә бер үк урында бер нуклеотид аермалары булган күренешне аңлата.Бер нигезне кертү, бетерү, конверсия һәм инверсия - болар барысы да бу аерманы китерергә мөмкин.Элек SNP төшенчәсе мутация төшенчәсеннән аерылып торган.Вариантлы локаль SNP бүлеге итеп билгеләнү өчен, халыктагы аллесларның ешлыгы 1% тан артык булырга тиеш.Ләкин, заманча биологик теорияләрнең киңәюе һәм технология куллану белән, аллеле ешлыгы SNP төшенчәсен чикләү өчен кирәкле шарт түгел.Милли Биотехнология Мәгълүмати Centerзәге (NCBI) карамагындагы Бер Нуклеотид Полиморфизмнары (dbSNP) мәгълүмат базасына кертелгән бердәм нуклеотид вариациясе мәгълүматлары да кертелгән, аз ешлыклы кертү / бетерү, микросатник вариациясе һ.б.

Кеше организмында SNP ешлыгы 0,1% тәшкил итә.Башкача әйткәндә, 1000 төп пар өчен уртача бер SNP сайты бар.Вакыйга ешлыгы чагыштырмача зур булса да, барлык SNP сайтлары да сыйфатларга бәйле кандидат билгеләре була алмый.Бу, нигездә, SNP булган урын белән бәйле.

Теоретик яктан, SNP геном эзлеклелегендә теләсә кайда булырга мөмкин.Кодлау өлкәсендә булган SNPлар синоним мутацияләр һәм синоним булмаган мутацияләр ясарга мөмкин, ягъни аминокислота мутациягә кадәр һәм аннан соң үзгәрми.Amзгәртелгән аминокислота гадәттә пептид чылбырының төп функциясен югалтуга китерә (миссенс мутациясе), һәм шулай ук ​​тәрҗемә абортына (мәгънәсез мутация) китерергә мөмкин.Кодлашмаган төбәкләрдә һәм интергеник өлкәләрдә булган SNPлар mRNA бүленешенә, кодсыз РНК эзлеклелеге составына, һәм транскрипция факторларының һәм ДНКның эффективлыгына тәэсир итә ала.Конкрет мөнәсәбәтләр рәсемдә күрсәтелгән:

SNP төрләре:

Берничә киң таралган SNP язу ысулы һәм аларны чагыштыру

Төрле принциплар буенча, гомуми SNP ачыклау ысуллары түбәндәге категорияләргә бүленә:

Ачыклау ысулларын классификацияләү

Искәрмә: таблицада күрсәтелгән хәзерге вакытта киң таралган SNP ачыклау ысуллары кулланыла, сайтны гибридизацияләү (ASH), махсус сайт праймеризы (ASPE), бер база киңәйтү (SBCE), махсус сайт кисү (ASC), ген чип технологиясе, масса спектрометрия технологиясе һ.б. классификацияләнмәгән һәм чагыштырылмаган.

Nгарыда күрсәтелгән берничә SNP ачыклау ысулында нуклеин кислотасын чистарту бәясе һәм вакыты котылгысыз.Ләкин, Foregene'ның туры PCR технологиясенә нигезләнгән бәйләнешле комплектлар турыдан-туры PCR яки qPCR көчәйтүне расланмаган үрнәкләрдә башкара ала, бу SNP ачыклауга күрелмәгән уңайлык китерә.

Foregene-ның туры PCR серияле продуктлары чистарту адымнарын гади һәм якынча калдыралар, бу шаблоннар әзерләү өчен вакытны һәм бәяне бик киметә.Уникаль Так полимерасы искиткеч көчәйтү сәләтенә ия һәм катлаулы көчәйтү мохитендәге төрле ингибиторларга түзә ала.Бу характеристикалар югары продуктлы продуктлар алу өчен техник гарантия бирә. Төрле үрнәк төрләр өчен Фореген туры PCR / qPCR комплектлары, мәсәлән: хайван тукымалары (тычкан койрыгы, зебрафиш һ.б.), үсемлек яфраклары, орлыклар (полисахаридлар һәм полифенол үрнәкләрен кертеп) һ.б.